おはよございます^^

ちょとよく分からないのですが、最新のカテゴリでソートというのは作成日付によるソートという意味でしょうか。カテゴリに関して日付によるソートはできません。

任意の順番で表示させたいのであれば手っ取り早くプラグインを使う方法があります。
http://www.h-fj.com/blog/archives/2008/10/20-164959.php
わたしは使ってませんがこのプラグインを使えば任意の順番に並べ替えることができるようです
上記プラグインを使って MTCategories ブロックタグで一覧表示すればできるのではないでしょうか。( 未確認 )

また、最新!? 5 件については MTCategories ブロックタグの中でカウンタをチェックすることで 5 件分を表示することができます。
たとえば、以下のように __counter__ が 5 件以内の場合表示、それ以外は除外というようにやります。

<MTCategories>
<mt:If name="__counter__" le="5">
    <$MTCategoryLabel remove_html="1" setvar="catname"$>
    <mt:IfNonZero tag="MTCategoryCount">
        <p><a href="<$MTCategoryArchiveLink$>"><mt:Var name="catname"></a></p>
    <mt:Else>
        <p><span><mt:Var name="catname"></span></p>
    </mt:IfNonZero>
</mt:If>
</MTCategories>

以上です。
ちなみにわたしはプラグインを使わずにカテゴリのソートを行ってます。
カテゴリ名の先頭に <00001> というような、<> で囲った数字の羅列をを付加することで降順に表示されるようになります。
実際に使うときは以下のように remove_html モディファイアと併用することで <0001> が削除されて表示さるようになります。

<$MTCategoryLabel remove_html="1"$>

こんなかんじの内容でよかったでしょうか